동양계 호박 과실 형질(과형, 과피색) GWAS 분석 결과

동양계 호박 과실 형질(과형, 과피색) GWAS 분석 결과

이은수

2026

유전육종 > 유전분석

2026-01-01

국립원예특작과학원

채소 > 과채류 > 호박

이예린,김도선,장윤정

국립원예특작과학원

동양계 호박 167자원을 수집하고, GBS 분석을 수행하여 10,492개의 SNP를 선발하였음. 선발한 SNP 정보와 과실 형질(과형, 과피색) 정보를 이용하여 전장유전체연관분석(GWAS)을 수행하였음. 수행한 결과는 각 형질별로 마커이름, 염색체 번호, 물리적 위치(bp), 유의값(p value), -log10(p)값, 형질 변이 설명력(%) 정보를 나타내었음.

전북특별자치도 완주군

동양계 호박 167자원을 대상으로 GBS 분석을 통해 유전체 데이터를 확보하였음. 일정한 기준에 의거하여 고품질 SNP를 10,492개 선발하였음. 해당 유전형 정보와 표현형 정보(과형, 과피색)를 활용하여, 형질과 연관된 유전자좌를 GWAS 분석을 통해서 탐색하였음. 분석은 GLM(General Linear Model)과 MLM(Mixed Linear Model) 2가지 모델을 이용했으며, 프로그램은 TASSEL v5.2.73을 활용하였음. MLM은 PCA+K 방식을 사용하였음. * 과형: fruit shape, 과피색: fruit rind color * 엑셀시트1: 과형에 대한 GWAS 분석 결과(GLM 모델 활용), 엑셀시트2: 과형에 대한 GWAS 분석 결과(MLM 모델 활용), 엑셀시트3: 과피색에 대한 GWAS 분석 결과(GLM 모델 활용), 엑셀시트4: 과피색에 대한 GWAS 분석 결과(MLM 모델 활용)

대한민국 (KR)

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SNP, 형질, GWAS

내외부공개

결과 데이터

https://doi.org/10.23138/RDA.20260204-00002.r1

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